单，刑部行使侦查权，都察院行使检察权，大理寺仍旧作为终审、审核机构，行使裁判权。
到了地方上却有些麻烦。大明的地方机构分为三使司、府与直隶州、县与散州。越到下面，朝廷的统治力就越薄弱，薄弱的结果就是行政官员身兼司法权。在府一级，明明设有推官，但知府仍旧有决策权。到了县一级，知县直接坐堂断案，视典史如无物。
要想让三法司各司其职，关键点就是地方法司的建立。
李明睿为此深居简出，利用自己的职权，有意地将山东按察使司分了三块，一块专管府县警察局，侦缉各类刑案；一块沟通监察御史，监督府县官员，接手警察局的刑案；最后一块便是联络各府推官，审理裁判。
这种做法固然不错，也在他的职权之内，但是痛苦之处在于皇太子将大明旧官撇到了一边，地方官吏根本不足数。许多府县都是一套班子，什么都管，比之甲申之前的状况还要混乱。
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