了一系列的重要科室，全权指挥全军之训练、部署、作战事务。不过为了牵制参谋部，赵东云依旧保持了教育部这个机构，把招募以及新兵训练的权力依旧独立出来，同时还把铨叙科从参谋部里独立出来成立铨叙处。
这个铨叙处是什么机构呢？和京师中央里的铨叙部门只有授衔的权力不同，东三省的这个铨叙处除了掌管授衔外，还实际拥有任命军官的权力，除了部分重要的中层职位以及高级职位由赵东云亲自安排外，其他的中低层任命统一由铨叙处安排，换句话说这机构拥有人事权。
这个机构单独设立也算是赵东云对参谋部以及在外将领日益权重的一个平衡安排，当然最为重要的是赵东云得始终把人事权抓在手里，容不得其他人染指，哪怕是孟恩远和林永权这些最嫡系的苏系将领都不行。
实际上铨叙处的存在以及教育部的存在，加上连军饷都是由军械处的薪饷处统一全军发放，而且是直接发放到士兵在奉天银行的银行账户里，这就导致苏系高层将领对部队的掌控力远远没有北洋其他几个军阀那么强悍。
以上都算是赵东云收拢中央军权、加强自身对部队掌控力的措施。
而伴随着东三省陆军司令部的改制一起进行的还有军方的布防工作，比如调第九师去哈尔滨，调第五混成旅去安东等。
随着这些部队的调动，赵东云也是及时调整了指挥体系，一月中旬，他撤销了锦州防务司令部、同时成立沈阳防务司令部、哈尔滨防务司令部，其中哈尔滨防务司令部由第九师师长林永权兼任、沈阳防务司令部由第十师师长徐邦杰兼任。
由此，赵东云麾下的三位最权势的将领都是分别坐上了防务司令的位置，军衔都是中`将衔，而苏系里有中`将衔的除了这三人外，还有一个就是新任第三师师长陈光远了。
至于少`将就比较多了，六个步兵旅的旅长比如孔眺北、顾蓝玉等人、三个混成旅的旅长比如曹锟、何宗莲、两个骑兵旅的旅长也就是华振基、吕双枪他们，然后还有司令部里的参谋