林弟子在山海关大战中的杰出表现，那种能以一人之上千个战斗力强悍的变种人士兵的卓绝战斗力，让大败之后的奥罗变种人贵族政权感受到了深深的威胁。可是，山海关一战，让变种人方面损失惨重，不得不暂时退守非洲大陆，沿苏伊士运河防线和奋起反击的人类联盟军对峙，这种情况下想要再度兵指少林，已经不太可能。
但是，对于新人类这个潜在的巨大威胁的深刻忌惮，让变种人贵族们转换了攻击方向。大规模的军事行动被停止了，军队开始保持缄默。而另一方面，大量自恃战斗力高超的变种人贵族高手开始接二连三地潜入人类社会，对中国境内的少林寺进行了连续不断、长达数年的偷袭骚扰。
虽然无常方丈一身功力惊天动地，少林僧众弟子也不乏高手，但是，单单靠一个千年大派，和占据了一整块大陆的整个变种人族群的高手进行对抗，难免会有落在下风的时候。在这数年当中，千年古剎少林寺数次被烧毁、破坏。少林弟子多有战死受伤，损失相当严重。
人类方面，当然不会坐视变种人毁灭掉少林寺——这个承载着人类对抗变种人希望的新人类武学巨派。以泛亚联盟为首，世界各国纷纷主动提供，协助中国保卫少林寺。只是人类普通士兵和变种人贵族高手之间的战斗力相去实在太远，并没能起到什么决定性的作用。不过。这些士兵也凭借着高科技地武器和人数上的优势，进行定点防御，总算是保住了少林藏经阁里珍贵的武学典籍。
在双方各有胜负的数年较量后，少林寺原有地建筑除了藏经阁、大雄宝殿等等人类重点防御地区域之外。大部分都在战斗中被摧毁。整个寺区破损严重。已经不再适合一向追求清净修行的僧人们居住。于是，无常方丈主动向中国政府和其它世界各国援助力量首领提出了一个设想。
与其花钱维修寺院。坐等被人再次上门拆屋，不如在敌人地手构不着或者不容易构着的地方。修建一座全新地少林寺，作为研究与培养新人类的基地。无常方丈并建议把这个基地的位置，修