民众集会为萧宇祈福。虽然这样做并没有什么用处，但是毕竟可以让他们得到心理上的安慰。
萧宇在离开的时候，留下了一个以自己为蓝本制作的庞大的智能程序，可是程序毕竟是程序，它是死的，智慧生物却是活的。于是它渐渐的不再适应文明发展的局面，最终，在大概五百年前它被废止了，只有一些诸如天气维持系统，生态循环系统之类的模块还在使用着。
神舟文明的民众们正在学习着如何依靠自己的力量来生活，依靠自己来独立完成科研实验，依靠自己来独立制造出各种型号的飞船，制造各种庞大的机械，自己来决定自己的命运，决定未来的规划等等。
就在这样的生活之中，两千多年时间过去了。和清扫者文明的战争给人们留下了太多的心理阴影，所以在这两千年时间之中，人们从来没有松懈过对战舰的制造。没有了萧宇，这些战舰便只能由智慧生物来亲自操纵，于是规模庞大的军队成立了，军事委员会在这个年代终于有了和自己规格相称的权力。
到现在为止，神舟文明已经拥有各类战舰一千余万艘，其中，恒星级战舰有两艘。现役军人二百亿名，预备军人大概三十亿。重生的神舟文明仍旧维持着多民族共存，和平共处的基本政策，最高领导机构仍旧是社会委员会，阿瑞斯担任了第一届委员长。
庞大的军力储备只是神舟文明为了自保的，神舟文明并没有主动侵略过其余任何文明。这种情况足足维持了两千多年，一直到现在。
在太阳系看来是天鹅座方向，距离银心大概一万光年的地方，神舟文明发现了一处七级文明的遗迹。这处遗迹原本隐蔽的很好，可是一颗超大质量恒星发生的光致蜕变超新星爆炸所引发的伽马射线暴将这个遗迹破坏掉了，它被神舟文明发现了。
经过初步的解析之后，神舟文明的科研人员确定这是一处旅行方向七级文明的遗迹。这是一座星门，也就是超远距离瞬间传送装置。据推测，旅行方向七级文明就是采用这种星门完成跨越无数河系的遥远旅程的。