当飞船突破地球大气层时，萧凡和林霜透过舷窗看到的，是一个被基因光辉笼罩的蓝色星球。大陆表面蜿蜒着紫金色与冰蓝色交织的纹路，那是新基因序列在地表形成的进化引导网络，而在北极圈上空，一个由暗物质与星光编织的双螺旋正缓缓旋转，如同地球的新光环。
“北美大陆的进化者正在建造基因塔，”艾文的声音带着忧虑，“但非洲部落的人拒绝接受新基因，他们称我们为‘篡改者’。”飞船降落在旧能源中心遗址时，迎接他们的是两派人类——一派背后生长着半透明的能量羽翼，另一派皮肤覆盖着类似克苏鲁的触手状纹路，正用原始武器互相攻击。
林霜的冰棱冻结了即将砍向孩童的石斧，萧凡的雷电铁棍却在接触进化者羽翼时自动收力：“我们不是来审判的。”他望向远处正在崩塌的基因塔，塔尖漂浮着当年能源中心的水晶残片，“真正的威胁在地下。”
能源中心的深渊此刻化作巨大的基因熔炉，岩浆中漂浮着由克苏鲁触手、星轨战体基因链与人类DNA编织的庞然大物——「熵灭之喉」。它的身躯如同流动的水银，每一处凸起都长着布满基因链的眼球，中央的巨口连接着地球核心，正将地热能转化为毁灭基因的暗物质洪流。
“它在吸收新基因序列！”林霜的冰系异能首次在地球重力场出现紊乱，“萧凡，它的核心是当年被我们摧毁的能源核心，现在融合了创世与毁灭之眼的碎片！”
克隆体小队在地表建立防线，阻止被熵灭之喉控制的进化者冲击。战斗机器克隆体的反物质炮在基因塔群中开辟通道，异能克隆体则用各自的进化能力与同类对抗——有人用恒星热能融化触手，有人用暗物质冰冻结暴走的基因链。
萧凡和林霜深入地心，发现熵灭之喉的巨口内壁布满与他们基因链完全一致的纹路。“它在模仿我们！”萧凡的雷电铁棍砸在巨口边缘，紫金色雷光却被转化为黑色触手，“霜儿，用基因共鸣切断它与地球核心的连接！”
林霜闭眼感受地球的心跳，当她