丞相之职，取消中书省。六部因此地位得到了提高。每部只设一个尚书，两个侍郎，原有的各科尚书降为郎中。各部尚书和侍郎的官阶也上升。其中以吏部（主管文官升迁）最为重要，户部人员最多。礼部（主管祭祀大典）与工部（主管公共建设）地位较低。
户部所主管的范围是全国的钱粮、田赋、户口，因此与各个少数民族势必产生一定的关系，因而更突显其重要地位。
户部设主官尚书一，秩正二品；副官左右侍郎各一，秩正三品；其下有浙江、湖广、江西、陕西、广东、山东、福建、河南、山西、四川、广西、贵州、云南十三司清吏司。各司设郎中一，秩正五品；员外郎一，秩从五品；主事二，秩正六品。
此外尚有照磨所、广积库、内、外承运库、军储仓等职司，因此又分为民、度、金、仓四科。
户部所涉及的少数民族事务集中体现在课税、茶贸易以及婚姻人口统计等方面。明朝虽然不禁止少数民族与汉族通婚，但必须事先呈报，不得私自嫁娶，违者，男女两家抄没入官为奴。
为了禁止私人贩茶，明朝任命了巡茶御史，还设立了茶马司、茶课司以及批验所等机构，归属户部管理，茶马交易是明朝控制青藏少数民族重要策略之一。
高峻山认为，户部的这些机构，还缺少一个，那就是银行。他要开办银行，吸纳富豪们的资金用于基础建设，主要还是修路搭桥，把交通搞上去，把全国的物流搞活。
开办银行之后，就要铸钱币，利用银行逐渐回收前朝的钱币，并发行本朝的钱币和纸钞，允许继续以白银作为法定的流通货币，一般交易大数用银，小数用钱，白银和铜钱、纸钞组成货币主体。
第二件事就是对礼部进行改制，礼部主管的范围比较广，有科考、外交、礼仪、祭祀、宴飨。其中礼仪、宴飨中包含了外交，当然还有一些其它的包括日常官员行为规范、礼仪礼节、公章管理、荣誉称号、庆典活动组织、庆功宴安排等等事