药物：雷帕霉素。作用机制：抑制由抗原及细胞因子白细胞介素2、白细胞介素4、白细胞介素6诱导的t细胞增殖和脂多糖诱导的b细胞增殖，肾毒性非常低，但有剂量依赖性，并且是可逆的。不良反应：可造成高胆固醇血症和高甘油三酯血症、感染、血液系统损害等不良反应。
干扰代谢药物代表药物，代表药物：霉酚酸酯，咪唑立宾。作用机制：竞争性抑制嘌呤合成系统中肌苷酸至鸟苷酸途径从而抑制核苷酸合成。不良反应：霉酚酸酯的不良反应主要为腹泻、白细胞减少及机会性感染。咪唑立宾主要不良反应有胃肠反应、血液系统障碍和过敏症状，偶见骨髓抑制和急性肾功能衰竭。咪唑立宾不在肝脏代谢，并证明没有明显的肝毒性，骨髓抑制也不明显，而免疫抑制效果与硫唑嘌呤相近，故被用作硫唑嘌呤的替代品。
fty720可使外周血中的t、b淋巴细胞数减少，从而对移植物的攻击减弱。由于fty720具有高度的细胞选择性，毒副作用低，避免了环孢素a过量所可能引起的肝、肾毒性。
目前已用于临床的生物制剂主要是某些抗免疫细胞膜抗原的抗体，如抗淋巴细胞球蛋白（alg）、抗胸腺细胞球蛋白（atg）、抗cd3、cd4、cd8单抗、抗高亲和力id2r单抗、抗tcr单抗、抗黏附分子（1cam-1、laf-1）抗体等。这些抗体通过与相应膜抗原结合，借助补体依赖的细胞毒作用，分别清除体内t细胞或胸腺细胞。某些细胞因子与毒素组成的融合蛋白、抗细胞因子抗体、某些黏附分子与免疫球蛋白组成的融合蛋白（如cfla-4-ig）等也具有抗排斥作用。
某些中草药具有明显免疫调节或免疫抑制作用。国内文献已报道某些中药如冬虫夏草等可用于器官移植后排斥反应的治疗。
清除预存抗体移植前进行血浆置换，可除去受者血液内预存的特异性抗体，以防止超急性排斥反应。
其他免疫抑制方法临床应用脾切除、放射照射移植物或受者淋巴结、血浆置