中国科学院“九五”特别支持项目的目标是：研制的PEMFC电池模块输出功率与国际同步，电池性能达到或超过国际90年代水平，并在石油、气象、铁路及通讯等部门，获得实际应用。承担上述项目的有中国科学院及部门所属的12个研究所，科研人员130余人。
重大攻关课题“技术”，在国家科技部和中国科学院的精心组织与大力支持下，取得了重大进展。中科院大连化物所研制并组装出100W至5KW多种规格的PEMFC电池组。用于30kW电动汽车的PEMFC发动机正在进行5kW单元的运行试验。“电动汽车装车实验研究”由中国科学院电工研究所负责，现已完成整车性能、电气主回路、电控系统及25kW驱动电机设计；建成了功率驱动台架试验系统。由中国科学院电工研究所负责的“PEMFC电源系统研制”课题，主要从事PEMFC电源系统关键技术研究和系统工程开发。建有可进行千瓦级PEMFC电源寿命试验的“系统实验室”。现已完成PEMFC移动电源专用微型H2/O2减压阀、多种小型金属储氢器及系列功率变换器等系统部件的开发。目前，正在进行自然对流型（无空气泵式）PEMFC便携式电源的系统集成工作。MCFC、SOFC、DMFC在基础研究和装置研制方面也取得了良好进展。中科院大连化物所组装出工作面积28cm2和110cm2的MCFC电池。中科院上海硅酸盐所全部采用国内原材料和自主研究的技术，建立并运行了一个10单元平板型SOFC电池堆，单电池有效面积9cm2，电池堆最大功率密度92mW/cm2。大连化物所正在进行SOFC电池材料、结构设计和组装技术的研究与开发，研制出的中温电池性能在800C°:时达到0.2W/cm2。中科院化工冶金所1995年从俄罗斯引进了200W块状叠层电池组进行了运行试验。中科院长春应用化学所对直接甲醇（DMFC）的电催化剂、电极、电极/膜集合体及单体电池的结构优化等进行了系统研究。80C°:常压